Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3KNL4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3KNL4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3KNL4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms