Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M3Q31093 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms