Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl1Q2VPR5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdgfl1Q2VPR5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl1Q2VPR5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl1Q2VPR5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl1Q2VPR5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms