Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms