Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms