Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms