Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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