Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300lgQ1ERP8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300lgQ1ERP8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms