Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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ptchd1Q14B62 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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ptchd1Q14B62 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ptchd1Q14B62 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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