Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms