Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc162pQ0VG85 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms