Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ttc39dQ0VF76 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ttc39dQ0VF76 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ttc39dQ0VF76 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ttc39dQ0VF76 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Ttc39dQ0VF76 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Ttc39dQ0VF76 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc39dQ0VF76 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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