Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
StumQ0VBF8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StumQ0VBF8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms