Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms