Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms