Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NeblQ0II04 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NeblQ0II04 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms