Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnma1Q08460 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms