Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gata4Q08369 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms