Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CbfbQ08024 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CbfbQ08024 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms