Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou6f1Q07916 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms