Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MestQ07646 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MestQ07646 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MestQ07646 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MestQ07646 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MestQ07646 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MestQ07646 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MestQ07646 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MestQ07646 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MestQ07646 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MestQ07646 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms