Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Col9a2Q07643 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms