Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdx4Q07424 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms