Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntn3Q07409 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn3Q07409 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms