Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox4Q06831 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms