Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf4Q06507 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf4Q06507 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms