Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Caprin2Q05A80 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Caprin2Q05A80 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms