Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms