Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox9Q04887 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms