Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sox8Q04886 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms