Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Emx2Q04744 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Emx2Q04744 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms