Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk16Q04735 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk16Q04735 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms