Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smarcad1Q04692 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarcad1Q04692 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms