Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms