Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NfiaQ02780 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfiaQ02780 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms