Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RykQ01887 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RykQ01887 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RykQ01887 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RykQ01887 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RykQ01887 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RykQ01887 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RykQ01887 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RykQ01887 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RykQ01887 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms