Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1cQ01815 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms