Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EgfrQ01279 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EgfrQ01279 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms