Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrcdQ00LT2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms