Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp1Q00915 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms