Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yy1Q00899 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Yy1Q00899 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Yy1Q00899 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Yy1Q00899 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms