Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VegfaQ00731 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms