Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb1Q00420 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb1Q00420 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms