Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx2Q00262 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx2Q00262 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms