Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PgrQ00175 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms