Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb4P99026 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb4P99026 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms