Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VldlrP98156 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms