Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfdP97946 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfdP97946 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfdP97946 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfdP97946 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfdP97946 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfdP97946 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfdP97946 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfdP97946 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms