Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AlkP97793 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AlkP97793 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AlkP97793 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AlkP97793 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AlkP97793 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AlkP97793 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AlkP97793 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AlkP97793 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AlkP97793 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AlkP97793 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AlkP97793 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AlkP97793 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AlkP97793 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AlkP97793 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlkP97793 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlkP97793 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlkP97793 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlkP97793 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AlkP97793 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
AlkP97793 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AlkP97793 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AlkP97793 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AlkP97793 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AlkP97793 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AlkP97793 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AlkP97793 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
AlkP97793 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AlkP97793 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AlkP97793 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlkP97793 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AlkP97793 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlkP97793 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlkP97793 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlkP97793 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlkP97793 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlkP97793 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlkP97793 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlkP97793 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlkP97793 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlkP97793 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlkP97793 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlkP97793 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms