Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cry1P97784 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cry1P97784 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cry1P97784 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms